Поскольку физалис недостаточно распространенная культура, то по сравнению с томатом или перцем он меньше подвержен массовому повреждению болезнями и вредителями. Однако при несвоевременной борьбе с ними урожай и качество плодов снижаются. Предотвратить широкое распространение болезней и вредителей и уменьшить вред, причиняемый ими, возможно при соблюдении профилактических мероприятий и применении методов систематической борьбы с ними.
Основными и общими мерами защиты физалиса против болезней и вредителей являются:
заготовка семян по возможности на своем участке, только со здоровых, урожайных растений, после предварительной апробации посева;
протравливание семян перед посевом;
соблюдение севооборота;
систематическая борьба с сорняками и вредителями, которые, помимо непосредственного вреда, служат переносчиками многих болезней;
удаление с участка растительных остатков (в компостную кучу) и осенняя перекопка почвы, способствующая ее биологическому оздоровлению и повышению урожайности культуры;
правильная агротехника, обеспечивающая нормальный рост и развитие растений.